一块水种好、色正、润度好、细腻、品相好的的翡翠价值肯定是价值连城，但如果翠体有瑕疵、即使质色绝佳，价值也会大打折扣。但是如果这个瑕疵能为翡翠锦上添花，那也值得拥有，所以明辨翡翠的瑕很是重要。常见的翡翠的瑕主要是纹与裂以及棉、色根等等，翡翠内部常见的一些纹路与构造。
玉石行内有句俗话“十玉九纹”，翡翠的纹，也叫“生长纹”，是指翡翠在形成过程中由于地质运动或者其他外力而产生的裂纹。纹路一般细、短、蜿蜒分布，其颜色和四周的材料的颜色不一样。翡翠的纹又分石纹与裂纹。翡翠的裂纹是由于人们在玉料开采加工或佩戴过程中，受到外力，翡翠受到磕碰、撞击，遭到破坏而形成的裂纹。一般来说，翡翠的裂肉眼可见，用指甲刮翡翠表明，可以明显感受到裂部分有阻塞感。用强光照射时，光线会被阻挡。
1.翡翠的石纹：石纹也是翡翠形成过程中由于受到外力，局部错位而导致错位处相邻部分的结构不均匀，形成的细微线纹。石纹肉眼可见，用指甲刮时感受不到阻塞感。用强光照射时，光线不被阻挡。石纹看起来像裂纹，但实际没有断裂，所以不影响翡翠的质地结构。
2.翡翠的色根：在绿色翡翠或其他颜色的翡翠成品或翡翠原料中，经常可以看见一点状或者是条带状的，颜色比较深一些的颜色（如绿色），慢慢渐变过渡到相对较浅的颜色，这类颜色深一些的颜色就称为色根。
3.翡翠的棉： 翡翠的棉就是在水头好的翡翠中常可以看见的团状或丝絮状的白色内含物，外观像棉花一样，所以人们将翡翠内部的这种团状或丝絮状白色内含形象地称为"石棉"，翡翠的石棉是翡翠的一部分，很多翡翠内部都会有石棉，冰种翡翠就可以看到有团状或丝絮状的白棉。翡翠的棉。有的棉会让翡翠很丑，但有的棉则成为翡翠的特色。
4.翡翠的杂色：翡翠内部小面积或点状的少数色。如果这些色的存在使翡翠首饰更漂亮更有特点，称为俏色；如果这些色使翡翠首饰更难看更低档，则称为杂色；点状的黑色、褐色、灰色等也叫脏点。